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倉庫 保管料 3期制 物流費 3PL

倉庫保管料

使用面積・坪単価・料金体系(1期制/3期制/月極/パレット制)・地域・温度帯から、月間保管料・入出庫料・付帯費用(検品・棚卸・返品処理)・年間物流コスト概算を即算出。
3PL事業者との契約前の見積比較、EC事業者の外部倉庫費用試算、標準倉庫寄託約款の料金体系理解、物流部門の外部倉庫委託判断のための無料計算ツールです。

最終更新:2026-07-29/監修:計算ツールズ編集部

倉庫保管料ツール

基本式

月額保管料 = 坪換算面積 × 坪単価(円/坪・月) × 料金体系係数

1㎡ = 0.3025坪(≒0.3坪)、100㎡=30.25坪

総物流費 = 保管料 + 入出庫料 + 付帯費(検品・棚卸・返品) + 消耗品費 + 管理費

保管料は「坪単価×使用坪数×料金体系」のシンプルな計算式ですが、実務では入出庫料(保管料の1.5〜2倍が実費目安)・検品料・棚卸料・返品処理料・消耗品費(段ボール・緩衝材・伝票)などの付帯費用を合わせた総額で比較する必要があります。100㎡・坪単価5000円で月額約151,000円が基本保管料で、月間500件の入出庫を伴うと総額20〜30万円のレンジになるのが3PL委託の一般的な水準です。

地域別 常温倉庫の坪単価相場

地域坪単価(円/坪・月)特徴
東京23区・都心近郊7,000〜12,000物流時間短、家賃高
関東近郊(埼玉・千葉・神奈川)4,000〜7,000物流拠点集積、標準ゾーン
関西(大阪・兵庫)4,000〜7,000第2大都市圏
中部(愛知)3,500〜6,000製造業拠点
地方(その他)2,500〜4,500安いが輸送費増

温度帯別 相場倍率

温度帯相場倍率用途
常温1.0倍一般貨物、EC商品
定温(15〜25℃)1.5〜2.0倍医薬品、化粧品、精密機器
冷蔵(0〜10℃)2.0〜3.0倍青果、乳製品、加工食品
冷凍(-20℃)2.5〜3.5倍冷凍食品、水産物、アイスクリーム
超低温(-50℃以下)4〜6倍特殊医薬品、マグロ、遺伝子医療

料金体系の比較

料金体系計算方法向く用途
月単位月極賃料長期在庫、専用スペース
1期制月末残高×単価入出庫少ない在庫
3期制各期(10日)開始残+期入庫×単価÷3入出庫頻度多い商品
パレット制パレット数×単価コンテナ・パレット単位保管

倉庫保管料の詳しい解説

倉庫保管料は「立地・温度帯・料金体系・付帯費用」の4軸で決まる複合コストで、単純な坪単価比較では実際の物流費が見えないことが多い分野です。標準倉庫寄託約款(1978年制定・2005年最終改定)に基づき、日本の営業倉庫は「保管料」「入庫料」「出庫料」「作業料」の主要料金カテゴリーで契約するのが業界慣行で、これらすべての合算で総物流費が決まります。

料金体系の3期制(さんきせい)は、日本の物流業界で最も広く使われる伝統的な計算方式です。1ヶ月を10日単位で3期(1〜10日、11〜20日、21〜末日)に分け、各期の開始時残高+その期の入庫数量を基準に保管料を計算します。入出庫の多い商品(食品・EC商品・季節商品)では、月末残高だけで計算する1期制よりも実態に近い課金となり、荷主・倉庫会社双方にとって公平です。一方で、動きの少ない在庫(工業原材料・スペア部品・アーカイブ資料)では1期制や月単位が合理的で、契約前の在庫回転率分析が重要になります。

入出庫料(いわゆる「作業料」)は保管料の1.5〜2倍が実費目安で、これを忘れると総物流費の3〜4割を過小評価します。荷物1件あたりピッキング50〜200円、検品30〜100円、梱包50〜300円、伝票発行30〜80円という細かい単価の積み上げで請求され、EC事業者の場合は「1出荷あたり300〜800円」の総合単価に集約されて契約されるのが一般的です。返品処理は通常出庫料の1.5〜2倍で、EC事業ではとくに返品率5〜15%の影響を無視できません。

温度帯管理は常温→定温→冷蔵→冷凍と、電力コスト・断熱設備・特殊車両の必要性で保管料が段階的に上昇します。医薬品はGMP・GDP準拠の定温保管が必須で、常温倉庫の2倍程度の単価。青果・乳製品の冷蔵は3倍前後、冷凍食品は3.5倍前後、-50℃以下の超低温はマグロ・特殊医薬品(mRNAワクチン等)向けで6倍以上のケースもあります。近年は電力価格高騰で冷凍・冷蔵倉庫の単価が10〜20%上昇するトレンドで、燃料サーチャージ・電力サーチャージの契約条項化が進んでいます。

近年の物流業界は「2024年問題(トラックドライバー時間外規制)」「物流総合効率化法」「ECの拡大」の3要因で構造変化中です。とくに2024年4月からのドライバー年間960時間規制で、都心近郊倉庫の需要が急伸し、東京23区・大阪市内の坪単価は2020年比で40〜60%上昇しました。物流不動産投資(J-REIT・海外私募ファンド)による大型物流施設の建設ラッシュも並行して、市場全体の需給バランスと価格形成に大きな変化が続いています。

EC事業・D2Cの成長を背景に、フルフィルメントサービス(FBA/Amazon MCF、楽天SBS、ヤマトフルフィルメント)や中小EC向けのマイクロフルフィルメントセンター(MFC)の展開も加速しています。EC事業者は「保管料+ピッキング料+梱包料+配送料+返品料」の統合料金でパートナー3PLと契約するのが一般的で、月間出荷1000件規模から月額数十万円〜数百万円のフィービジネスとなります。売上規模と物流費比率(通常10〜15%)を意識した外部委託 vs 自社倉庫の意思決定が経営判断として重要です。

業界・現場での使い方

EC事業者・D2Cブランド

倉庫委託先の比較検討、フルフィルメントサービス選定、自社倉庫との損益分岐点計算。月間出荷件数・平均返品率・SKU数を元に、AmazonFBA/楽天SBS/ヤマトフルフィルメント/中小3PLの4パターン程度で総合単価を比較し、売上規模5000万〜20億円のスケール別に最適解を判断します。

製造業・メーカー物流

原材料・半製品・完成品の外部倉庫委託費用試算。工場敷地内保管vs近隣3PL委託の損益分岐計算、部品SKU数・入出庫頻度別のTMS/WMS導入判断。JIT納品(かんばん方式)との連動、鉄鋼・自動車部品・機械部品での多品種少量倉庫運用が典型的です。

3PL事業者(荷主向け見積作成)

坪単価・入出庫料・付帯費用を組み合わせた統合料金の提案。競合他社との差別化のための料金体系設計、月間見積・年間契約の切替、キャンペーン期の作業料変動の織り込み。荷主に応じた1期制/3期制/月極/パレット制の提案が実務。

物流部門(社内経理・購買)

年間物流費の予算策定、月次実績の予算対比分析、外部委託費用の妥当性検証。物流コストは売上高の5〜15%を占める大きな費目で、経営指標(物流ABC分析、SKU別コスト計算)に基づく削減・最適化提案が求められます。

物流不動産・J-REIT

賃貸物件としての想定賃料設定、テナント誘致時の坪単価競争力分析、物流施設の適正収益性判定。ラサール・GLP・プロロジス・大和ハウス系の物流REITでは月坪単価4000〜10,000円の物件が主要ポートフォリオ。

食品・医薬品・化粧品業界

定温・冷蔵・冷凍の温度帯管理付き倉庫の費用試算。GMP・GDP・HACCP準拠、コールドチェーン維持コスト、賞味期限管理・ロット管理・入替頻度の高いオペレーションでの総合コスト設計が必要です。

ケーススタディ:現場での実務計算

ケース1:EC事業者の関東近郊倉庫委託

  • 使用面積100㎡、坪単価5,000円/坪・月、月単位、常温、月500件出荷
  • 坪換算 = 100 × 0.3025 = 30.25坪
  • 月額保管料 = 約151,000円
  • 入出庫料 = 500件 × 平均300円 = 150,000円
  • 付帯費(検品・梱包・伝票) = 60,000円 → 総月額約36万円、年間430万円

ケース2:中小EC(月出荷2,000件)の3PLパートナー

  • 使用面積200㎡、都心近郊、常温、3期制、月2,000件出荷
  • 坪換算60.5坪、坪単価7,000円 → 保管料約423,500円/月
  • 入出庫料 = 2000件×600円 = 120万円/月
  • 返品率5% = 100件×返品処理費500円 = 5万円/月
  • 総月額約165万円/年間2,000万円、売上比10%レンジ

ケース3:食品メーカーの冷蔵倉庫委託

  • 関東近郊、冷蔵倉庫(0〜10℃)、200㎡、坪単価12,000円/坪・月、3期制
  • 坪換算60.5坪、月額保管料 = 約726,000円
  • 入出庫料(冷蔵作業割増30%) = 1000件×650円=約65万円
  • 付帯費(温度管理記録・トレーサビリティ) = 15万円
  • 総月額約152万円、年間1,800万円のコールドチェーン費用

ケース4:自社倉庫 vs 3PL委託の損益分岐

  • 月間出荷1,500件、必要面積150㎡
  • 自社倉庫案:賃料60万+人件費80万+光熱10万+システム20万=170万円/月
  • 3PL委託案:保管料23万+入出庫料100万+付帯20万=143万円/月
  • 3PL委託が月27万円有利、年間324万円の削減効果
  • ただし出荷2,500件以上に増えると自社倉庫の固定費が有利化

ケース5:医薬品定温倉庫のGDP準拠コスト

  • 関東、定温倉庫(15〜25℃)、100㎡、坪単価9,000円/坪・月、月単位
  • 坪換算30.25坪、月額保管料 = 約272,000円
  • 入出庫料+温度モニタリング+ロット管理 = 25万円/月
  • 年次バリデーション費用(温度分布試験等) = 100万円/年
  • 総月額約53万円+年次100万円、GDP認証維持のコスト構造

ケース6:3期制と1期制の差額試算

  • 使用面積150坪、坪単価5,000円、月内入出庫頻度高い商品
  • 1期制(月末残高10坪) = 10坪×5000円=50,000円/月
  • 3期制(各期平均40坪) = 40×5000÷3期×3期=200,000円/月
  • 入出庫の多い商品は3期制が実態反映で公平、動きが少ない在庫は1期制が有利

よくある間違い・注意点

  • 入出庫料・付帯費用の考慮忘れ — 保管料だけで比較すると総物流費の30〜40%を過小評価する。1件あたり300〜800円の入出庫料、返品処理料、検品料、伝票発行料を合算した「1件あたり総合料金」で比較するのが正解。
  • 3期制と1期制の混同 — 入出庫の多い商品では3期制が実態反映で高くなり、動きが少ない商品では1期制の方が安い。契約体系選定に商品特性・在庫回転率を反映しないと年間で数十%の差が出ます。
  • 坪単価だけで地域比較 — 都心近郊は坪単価が高いが物流時間短で配送費が安い、地方は坪単価安いが輸送費増。物流費全体(保管料+輸送費+配送費+人件費)で総合比較が必要です。
  • 温度帯の要件見誤り — 医薬品はGDP準拠の定温、食品はHACCP準拠の温度管理と、業界特有の要件を無視すると法令違反や品質事故に。契約前に温度分布バリデーション実施を求めるのが実務標準です。
  • 保管効率の無視 — ラック未使用の平置きで坪数が2倍、パレット搭載数の少ない立体保管で3〜4倍の効率悪化。ロケーション設計・WMS(倉庫管理システム)・自動倉庫の投資対効果検討が有効。
  • ピーク期の在庫増加を織り込まない — 季節商品・年末年始・キャンペーン期の在庫増を平常時比で契約すると、ピーク期に追加料金が発生。年間ボリューム予測+マージン契約が実務標準です。
  • 電力・燃料サーチャージ未確認 — 冷凍冷蔵倉庫は電力コスト、輸送は燃料コスト連動が近年契約標準化。長期契約でも変動条項を確認しないと想定外の値上げが発生します。

関連する規格・法規

  • 倉庫業法 — 営業倉庫の登録制、寄託約款の届出、災害時の免責事項、賠償責任等を規定する基本法。
  • 標準倉庫寄託約款(国土交通省) — 業界標準の契約書式。保管料・入出庫料・作業料・付帯料の料金体系を規定。
  • 物流総合効率化法 — 総合物流施策大綱に基づく物流効率化施設への支援。荷役自動化・共同配送・モーダルシフトが対象。
  • 労働基準法(2024年4月改正) — トラックドライバー時間外960時間上限。物流業界の「2024年問題」を招き、料金相場・拠点戦略に構造的影響。
  • 食品衛生法(HACCP) — 食品倉庫の温度管理・衛生管理義務、GMP準拠。
  • 医薬品医療機器等法(GDP・GMP) — 医薬品倉庫の定温管理、トレーサビリティ、認証要件。
  • 消防法(危険物・指定可燃物) — 危険物倉庫の指定数量、防火壁、消火設備の要件。
  • 建築基準法(倉庫用途) — 建築確認、耐火要件、日影規制、床荷重(4-15kN/㎡)の技術基準。
  • 労働安全衛生法(倉庫作業) — フォークリフト運転免許、荷役事故防止、5S・KY活動の管理義務。

※本ツールは業界慣例・市場相場に基づく参考計算です。実際の倉庫委託契約は物件・エリア・時期・業種・数量・付帯サービスで大きく変動するため、必ず複数社見積・現地視察・契約書精査を実施してください。標準倉庫寄託約款の適用範囲、賠償責任、災害時免責等の重要条項は、専門の物流コンサルタント・弁護士への確認をお勧めします。

よくある質問(FAQ)

100㎡・坪単価5000円の月額は?

100㎡ = 30.25坪、月額保管料 = 30.25 × 5,000 = 約151,000円。ただし入出庫料(月間300〜200円/件×件数)、付帯費(検品・棚卸・返品処理)を合算した総物流費で判断する必要があります。

3期制と1期制の違いは?

3期制は1ヶ月を10日単位の3期に分け、各期の開始残高+期入庫を基準に計算。入出庫の多い商品向き。1期制は月末残高だけで計算する簡便方式で、動きの少ない在庫向きです。

倉庫の坪単価相場は?

常温倉庫で東京23区・都心近郊7,000〜12,000円、関東近郊4,000〜7,000円、地方2,500〜4,500円が2026年時点の目安。2024年問題の影響で都心近郊は2020年比+40〜60%上昇しています。

冷蔵・冷凍倉庫は何倍高い?

常温1.0倍を基準に、定温(15〜25℃)1.5〜2倍、冷蔵(0〜10℃)2〜3倍、冷凍(-20℃)2.5〜3.5倍、超低温(-50℃以下)4〜6倍。電力価格高騰で近年更に上昇傾向です。

入出庫料の相場は?

ピッキング50〜200円/件、検品30〜100円/件、梱包50〜300円/件、伝票30〜80円/件で合計。EC事業者向けの「1出荷あたり」統合単価は300〜800円が一般的です。

フルフィルメントサービスは何が違う?

Amazon FBA・楽天SBS・ヤマトフルフィルメント等は保管+ピッキング+梱包+配送+返品まで一括サービス。EC事業者は個別3PL委託より運用が楽ですが、SKU数・出荷量・返品率で総合コストが変動します。

自社倉庫と3PL委託の損益分岐は?

月間出荷1000〜3000件レンジが境界目安。それ以下は3PL委託が有利、それ以上は固定費償却で自社倉庫が有利化します。業種・商品・エリアで大きく変動するため、5年程度の物流計画で試算するのが実務です。

2024年問題の影響は?

トラックドライバー年間960時間規制で、輸送費上昇+配送圏縮小。結果として都心近郊倉庫の需要急増、坪単価40〜60%上昇、地方倉庫との輸送費差の再検討が必要になりました。

物流費は売上の何%が適正?

一般的に売上高比5〜15%。低単価大量商品(食品・飲料)は10〜20%、高単価小口商品(精密機器・ジュエリー)は3〜7%、EC事業者は7〜15%が典型。業界別ベンチマークとの比較が経営判断に有効です。

物流費を下げる有効な方法は?

①拠点集約(2拠点→1拠点)、②パレット化・ユニットロード化、③WMSによるロケーション最適化、④共同配送・共同保管、⑤自動倉庫・ロボット導入、⑥ABC分析による重点管理の6手法が代表的です。

用語集

3PL (Third Party Logistics)
荷主でも運送会社でもない第三者物流事業者。ヤマト・佐川・SBS・SG系・センコー・鴻池運輸等。
3期制
1ヶ月を10日単位で3期に分けて保管料を計算する日本の伝統的料金体系。
1期制
月末残高だけで保管料を計算する簡便方式。動きの少ない在庫向き。
パレット制
パレット数×単価で保管料を計算する方式。ユニットロード商品向き。
坪(つぼ)
3.30578㎡。日本の伝統的な面積単位で、倉庫業界で標準的に使用。
ピッキング
受注ごとに商品を倉庫からピックアップする作業。EC倉庫の主要作業。
WMS (Warehouse Management System)
倉庫管理システム。入出庫・在庫・ロケーション・作業進捗を管理。
TMS (Transportation Management System)
輸配送管理システム。配送計画・積載効率・追跡管理を担う。
FBA (Fulfillment by Amazon)
Amazonのフルフィルメントサービス。保管〜出荷〜配送〜返品を一括代行。
マイクロフルフィルメント(MFC)
店舗併設・都市近郊の小型倉庫。ラストマイル配送の高速化に有効。
コールドチェーン
低温物流。生産〜倉庫〜輸送〜配送〜店舗まで温度を一貫管理する仕組み。
GDP (Good Distribution Practice)
医薬品適正流通ガイドライン。定温倉庫のバリデーション必須。
HACCP
Hazard Analysis and Critical Control Points。食品安全管理システム、法制化済み。
2024年問題
トラックドライバー年間960時間規制。物流業界の構造変化を招いた社会問題。
ABR分析(ABC分析)
SKUを重要度別に3層に分類して管理する在庫管理手法。
ユニットロード
パレット・コンテナ単位でまとめる荷役方式。作業効率を大幅向上。
自動倉庫(AS/RS)
Automated Storage/Retrieval System。ラック+クレーンでの自動入出庫。
クロスドッキング
倉庫内保管を経ずに入荷即出荷する高効率物流方式。
D2C
Direct to Consumer。ブランドが直接消費者に販売するEC事業モデル。

倉庫選定・見積比較チェックリスト

  • ①要件定義 — SKU数、月間入出庫件数、返品率、温度帯要件、稼働時間、繁閑差の把握。
  • ②立地選定 — 主要出荷先エリア、配送圏、物流拠点(高速道路・空港・港)へのアクセス。
  • ③料金体系選定 — 商品特性に応じて1期制/3期制/月極/パレット制の選択。
  • ④見積比較 — 保管料・入出庫料・付帯費・消耗品費を分解した比較表作成。
  • ⑤契約条項確認 — 標準倉庫寄託約款、賠償責任、災害免責、値上げ条項、サーチャージ条項。
  • ⑥現地視察 — 建物構造、床荷重、消防設備、セキュリティ、温度管理体制、作業員質。
  • ⑦システム連携 — WMS/TMS/ERP連携、受注データ連携、API・EDI仕様確認。
  • ⑧品質保証 — GDP/HACCP/GMPなど業界認証、温度モニタリング、トレーサビリティ体制。
  • ⑨試験運用 — 1〜3ヶ月の試験運用でオペレーション適合性を確認。
  • ⑩契約書レビュー — 弁護士・物流コンサルタントによる契約条項精査。

まとめ・実務ポイント

倉庫保管料の設計は「立地・面積・温度帯・料金体系・付帯費用」の5軸で総合コスト最適化を図るのが実務の起点です。単純な坪単価比較では総物流費の40%を占める入出庫料・付帯費用を過小評価するため、「1件あたり総合料金」+「月間ボリューム」+「返品率」+「温度帯コスト」の統合比較が正解です。

2024年問題の影響で都心近郊倉庫の需要急伸+坪単価上昇と、地方倉庫の輸送費増のトレードオフが構造化しました。EC事業者・製造業・食品/医薬品業界とも、拠点戦略・自動化投資・共同配送・WMS導入を組み合わせた総合物流最適化が経営課題です。本ツールで基本保管料を算出し、複数3PL見積・現地視察・契約条項精査を組み合わせて、最適な物流パートナー選定と年間コスト最適化にご活用ください。

参考文献・公的リソース

  • 国土交通省「倉庫業法・標準倉庫寄託約款」mlit.go.jp
  • 国土交通省「総合物流施策大綱・物流総合効率化法」mlit.go.jp
  • 厚生労働省「トラックドライバー2024年問題・時間外規制」mhlw.go.jp
  • 日本ロジスティクスシステム協会(JILS)「物流コスト調査」logistics.or.jp
  • 日本倉庫協会「倉庫業界統計・料金ガイド」nissokyo.or.jp
  • 経済産業省「電子商取引に関する市場調査」meti.go.jp
  • 公益社団法人日本ロジスティクスシステム協会「LOGI-BIZ 業界誌」logi-biz.com